<기독교고전총서>는 초대(1~8권), 중세(9~13권), 종교개혁(14~20권)의 세 시기로 구성되어 있다.

초대
1 초기 기독교 교부들
2 알렉산드리아 기독교: 클레멘스와 오리게네스
3 후기 교부들의 기독론
4 초기 라틴 신학
5 아우구스티누스: 전기 저서들
6 아우구스티누스: 고백록과 신앙편람
7 아우구스티누스: 후기 저서들
8 사막 교부들의 금언집

중세
9 중세 초기 신학
10 스콜라 신학 선집: 안셀름부터 오캄까지
11 신학대전: 자연과 은총에 관한 주요 문제들
12 중세 후기 신비주의
13 개혁의 주창자들: 위클리프부터 에라스무스까지

종교개혁
14 루터: 로마서 강의
15 루터: 초기 신학 저술들
16 루터와 에라스무스: 자유의지와 구원
17 멜랑히톤과 부처
18 칼뱅: 신학논문들
19 츠빙글리와 불링거
20 성령주의와 아나뱁티스트 종교개혁자들